Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms