Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms