Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20917Q62457 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms