Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms