Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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AtmQ62388 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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AtmQ62388 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtmQ62388 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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