Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema3cQ62181 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms