Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcanQ62059 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VcanQ62059 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms