Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd2Q61285 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms