Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc6Q61143 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms