Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms