Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik1Q60934 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms