Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms