Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stxbp3Q60770 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms