Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms