Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms