Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms