Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprnQ60673 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms