Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms