Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mybpc2Q5XKE0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mybpc2Q5XKE0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms