Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arcn1Q5XJY5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Arcn1Q5XJY5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Arcn1Q5XJY5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Arcn1Q5XJY5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Arcn1Q5XJY5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Arcn1Q5XJY5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Arcn1Q5XJY5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Arcn1Q5XJY5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms