Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms