Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms