Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tns3Q5SSZ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tns3Q5SSZ5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms