Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TefmQ5SSK3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TefmQ5SSK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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