Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb5d2Q5SSH8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms