Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms