Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms