Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms