Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms