Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vps41Q5KU39 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms