Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnni3kQ5GIG6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms