Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Nlrc3Q5DU56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Nlrc3Q5DU56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Nlrc3Q5DU56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Nlrc3Q5DU56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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Nlrc3Q5DU56 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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