Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms