Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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