Protein–RNA interactions for Protein: Q505G8

Znf827, Zinc finger protein 827, mousemouse

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf827Q505G8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Znf827Q505G8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Znf827Q505G8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Znf827Q505G8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Znf827Q505G8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Znf827Q505G8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Znf827Q505G8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf827Q505G8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf827Q505G8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms