Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC100530Q497J0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms