Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms