Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms