Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3V0E1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3V0E1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3V0E1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3V0E1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms