Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmed1Q3V009 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmed1Q3V009 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmed1Q3V009 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms