Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms