Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms