Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms