Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms