Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms