Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms