Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod2Q3UHZ5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms