Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Nkx6-3Q3UHX8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms