Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms