Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser2Q3UHI0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser2Q3UHI0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms